La legislazione fitosanitaria persegue prioritariamente l´obiettivo di limitare il rischio di introduzione e diffusione di organismi dannosi alle piante e di contenerne i danni economici e ambientali. Negli ultimi anni, a livello nazionale e comunitario, questo rischio è notevolmente aumentato a causa dell´intensificazione degli scambi commerciali e delle sensibili variazioni climatiche.

E´ compito del Servizio fitosanitario controllare tutte le aziende regionali che professionalmente producono, commercializzano o importano piante, sementi, legname a scopi agricoli, industriali e commerciali, nonché i vivai e le aziende iscritte al Registro Ufficiale dei Produttori (R.U.P.) che commercializzano materiale vegetale "a rischio".
Per garantire la rispondenza ai requisiti fitosanitari europei dei vegetali provenienti da Paesi terzi, le merci vengono sottoposte a rigorosi controlli nei punti di ingresso dell´Ue (porto di Ravenna e aeroporti)

Anche i vegetali e prodotti vegetali destinati all´esportazione, sono soggetti di controlli ufficiali per l´emissione di certificati fitosanitari che ne attestano la rispondenza ai requisiti fitosanitari.

L´attività ispettiva mira a prevenire o contenere, attraverso il costante monitoraggio del territorio regionale e l´applicazione di normative di lotta obbligatoria, la diffusione di organismi da quarantena non presenti o non ancora diffusi in forma endemica nella regione.

Laboratori diagnostici articolati nelle sezioni specializzate di micologia, batteriologia, virologia, nematologia, entomologia ed acarologia consentono al Servizio fitosanitario l´accertamento degli organismi previsti dalle normative fitosanitarie.

Oltre a essere l´organismo competente per l´autorizzazione all´esercizio dell´attività vivaistica, all´emissione del Passaporto verde e all´accreditamento delle imprese e dei laboratori fornitori di materiale vegetale con i requisiti di qualità CE, il Servizio fitosanitario collabora con le istituzioni nazionali e regionali competenti in materia di ambiente e sanità per quanto riguarda l´applicazione delle normative sui prodotti fitosanitari. In particolare si occupa delle norme relative alla commercializzazione e all´impiego dei prodotti fitosanitari sia per ciò che attiene il rilascio delle autorizzazioni necessarie (patentini, certificati abilitazione alla vendita) che per quanto riguarda le attività di controllo previste dalla legislazione nazionale e comunitaria (controlli sugli alimenti, sulle acque ecc..). Interviene anche nelle procedure che riguardano il rilascio delle autorizzazioni per l´impiego di gas tossici in agricoltura e l´utilizzo dei mezzi aerei nell´esecuzione di trattamenti fitosanitari ad alcune colture agrarie.

L´attività svolta è finalizzata alla definizione di criteri per la valutazione dei prodotti fitosanitari da inserire nei disciplinari di produzione integrata nell´ottica di minimizzare i rischi a carico della salute umana e dell´ambiente.
Il Servizio collabora con le strutture nazionali e regionali incaricate dell´effettuazione dei controlli sugli OGM e gestisce inoltre direttamente o a supporto di altre strutture gli interventi a sostegno delle aziende agricole colpite da gravi fitopatie.

Tutte queste attività relative all´applicazione delle normative fitosanitarie sono svolte da Ispettori fitosanitari (ex Delegati speciali per le malattie delle piante).
Nell´espletamento dei loro compiti, gli ispettori sono funzionari di polizia giudiziaria: hanno l´incarico di vigilare sull´attuazione delle normative vigenti, constatare violazioni ed applicare le sanzioni che ne conseguono.
Sono iscritti al Registro nazionale degli Ispettori fitosanitari e sottoscrivono atti e certificati fitosanitari ufficiali a valenza internazionale.